临床上肾没有功能或者肾实质结核的广泛的破坏，合并有难以控制的高血压或肾输尿管连接部梗阻者，肾结核合并肾细胞癌者。在做肾切除之前一定要关注对侧肾功能的情况，确保对侧肾功能正常再进行换肾的切除， 输尿管结核如果在输尿管和膀胱连接部短的狭窄和肾脏破坏不明显，可以采取内支架扩张引流。对于附睾结核其单纯的一个附睾结节可以采用药物治疗，如果附睾结核破溃了阴囊形成了脓肿，这个时候就需要采取手术治疗清除脓肿
临床上肾没有功能或者肾实质结核的广泛的破坏，合并有难以控制的高血压或肾输尿管连接部梗阻者，肾结核合并肾细胞癌者。在做肾切除之前一定要关注对侧肾功能的情况，确保对侧肾功能正常再进行换肾的切除， 输尿管结核如果在输尿管和膀胱连接部短的狭窄和肾脏破坏不明显，可以采取内支架扩张引流。对于附睾结核其单纯的一个附睾结节可以采用药物治疗，如果附睾结核破溃了阴囊形成了脓肿，这个时候就需要采取手术治疗清除脓肿
鼻咽腔比较小，鼻咽的侵犯比较早期，通过鼻腔内镜去病检的时候，可能就把手术做了，病人术后补充放射治疗，对于复发的病人，是可以考虑复发以后的手术治疗，因为二次放疗对鼻咽可能会导致正常组织进一步损伤，同时正常组织损伤也会加大，所以这种病人可以通过手术治疗的方式，让病人生活质量得到提高。
胃溃疡患者需要手术治疗的情况有： 1、当病人出现消化道大出血，经过保守治疗，内镜下止血治疗或者是血管的介入治疗，都不能使溃疡止血的时候。 2、如果病人出现严重的穿孔以后，出现腹膜炎的体征的时候。 3、当胃溃疡发生幽门梗阻，尤其是幽门管溃疡出现瘢痕狭窄导致梗阻，通过内科服药保守治疗不能够使梗阻解除，或者是在内镜下通过球囊扩张仍然不能解除梗阻的情况下。 4、溃疡病人如果复查胃镜高度怀疑是肿瘤的时候。
主要可以分为两个方面：一方面是疾病进展到非手术不可的阶段：包括了①大出血不止或反复大出血；②结肠出现了穿孔；③出现了中毒性巨结肠；④结肠出现了狭窄或者癌变，出现了狭窄的病人需要手术的原因是大部分狭窄的患者容易伴随或者进一步发展为结肠癌，及早手术可以早期切除癌变的结肠；另一方面是药物没有办法有效地控制病情的阶段：包括了①用了大量的激素、免疫抑制剂、生物制剂类克等药物治疗后病情完全没有改善，这种时候就该考虑手术了，而且越早对病人越好，谨记！延迟了会有生命危险！一般公认的是激素治疗无效（治疗3天）后就应该考虑是否手术。②用了激素或者其他药物治疗效果很好，但是激素一停药就复发；③以前因为急诊手术，切了部分结肠，剩下的结肠仍然有炎症反复发作；这种病人应该找有经验的溃疡性结肠炎中心治疗，因为后面的手术难度大，容易出现手术并发症。④如果部分青少年儿童因为溃疡性结肠炎疾病导致影响生长发育的也可以考虑手术治疗。
一般根据患者的不同需求，比如要是患者是文字工作者，然后他又比较年轻还在职，所以他对眼睛的要求就会比较高，可能他0.6的视力就已经影响他的工作了，那我们就可以考虑给他手术治疗，但是对于一个不经常用眼的退休在家的，全身情况又不是很好的一个老年患者的，就是可以再评估一下，如果他要是不愿意进行手术治疗，可以等一等比如能到0.3的视力再进行手术治疗，根据个人的情况综合评估。
对于部分病因明确的重度少弱畸形精子症患者及无精子症患者需要手术治疗。临床常见的男性不育手术治疗包括三大类，提高睾丸生精功能改善精子生精环境的手术，提高精子输送能力，疏通输精管道的手术;针对无精症患者经睾丸提取精子的手术。
