脚趾甲凹凸不平可能是由于缺乏营养导致的，也可能是灰指甲引起的。
如果趾甲同时出现颜色发暗、凹凸不平的情况，则可能是营养不良的表现或者近段时间出现过身体不调所导致的。建议日常补充营养，多食瘦肉、动物内脏、动物血、蛋黄、蔬果等。在补铁的同时，还要补充维生素C丰富的食物（如狝猴桃、草莓、大枣、柚子等）。
除了营养缺乏导致的外，灰指甲也可能导致脚趾甲凹凸不平。灰指甲，医学上称为甲癣，是指皮癣菌侵犯甲板或甲下所引起的指甲感染的甲真菌疾病。它不仅会影响甲的美观，还会引起嵌甲、甲沟炎、甲床炎等并发症。因此，发现灰指甲后，可再医生指导下通过药物和拔甲治疗。其中拔甲只能清除掉指甲上面的真菌，甲床上的真菌并没有杀死，因此在灰指甲的治疗中，需要足疗程、足剂量的配合抗真菌药物。一般情况下口服药物后需要2个月时间才能见到明显的效果，正常甲逐步取代病变的甲，从而使疾病转愈。
因此，当脚趾甲凹凸不平时，需要及时前往医院就诊，根据病因采取针对性治疗。