按目前国际和国内的指南异基因造血干细胞移植主要用于中危2型和高危的治疗，有预后不良的基因、有输血依赖的患者、对前期的免疫抑制剂或细胞因子治疗效果不好的患者也可以考虑进行移植。而骨髓增生异常综合症有许多分型，有危险度的分层，因此造血干细胞移植可以用于骨髓增生异常综合征的治疗。
按目前国际和国内的指南异基因造血干细胞移植主要用于中危2型和高危的治疗，有预后不良的基因、有输血依赖的患者、对前期的免疫抑制剂或细胞因子治疗效果不好的患者也可以考虑进行移植。而骨髓增生异常综合症有许多分型，有危险度的分层，因此造血干细胞移植可以用于骨髓增生异常综合征的治疗。
确定了骨髓异常增生综合征以后，再根据原始细胞的情况，细胞减少的情况和遗传学的情况，来给他打分评估他属于低危组还是属于高危组。因为低危和高危它的治疗不同，如果是低危的病人往往会选择中药加刺激骨髓造血的药物，或者选择骨髓免疫调节的药物，选择刺激红细胞生成的药物。骨髓增生异常综合征属于高危组的病人，我们会选择去甲基化治疗。
骨髓增生异常综合征治疗的误区：治疗过程中，最常见的误区就是对病重视不够。有一些患者确实是因为慢性的长期贫血起病的，就诊的时候，往往患者不以为然，建议配合一定的氧疗，他们都会拒绝。还有个误区是皇者不注重监测，尤其是对于可能向急性白血病转化的类型，要定期要复查血常规，监测脏器功能等。
骨髓增生异常综合征的治疗要根据个人的情况，采取不同的治疗方法，具体如下： 一、对低危的患者，一般采取支持对症治疗，加促造血的药物或者免疫抑制剂。在血液方面，血常规恢复和骨髓造血功能的改善，从而达到延长生存期的目的。 二、对中高危的患者，可以采取去甲基化药物，针对疾病的发病机制也可以采取免疫调节剂。如果原始细胞增多，容易向白血病转化，这些患者采取的治疗方式，经常是去甲基化药物联合化疗。通过化疗使造血功能恢复，病态造血减少，从而达到血象恢复，起到延长生存期的作用。 三、对于高危的患者或者是输血依赖的患者，如果有合适的供体积极的采取异基因移植，可以达到根治的目的。
造血干细胞移植可以用于哪些方面：造血干细胞移植技术是掌握在血液科大夫手里的。对这个技术的应用，主要是应用于血液系统疾病，也可以应用于其他系统的疾病。在我们国家以及国际上，目前大多数还是应用于血液系统的疾病。血液系统疾病当中一些良性疾病和大部分的恶性疾病都可以应用造血干细胞移植，来获得根治。在良性疾病当中，比如地中海贫血、严重的免疫联合缺陷性疾病，还有重型再生障碍性贫血等等。造血干细胞移植可以应用于这些良性的血液系统疾病来做根治性的治疗。恶性的血液系统疾病，比如说白血病，淋巴瘤、骨髓瘤，还有一些骨髓增殖性肿瘤以及其他一些疾病，都可以应用造血干细胞移植来得到根治。但是它移植的术式的选择是非常具有策略的。
中医对于骨髓增生异常综合征的治疗主要是辨证治疗。从气血、阴阳这些方面来进行辨证，如针对气阴两虚证，要益气养阴，气血亏虚要益气养血。针对不同的病人，要进行客观的以及医生正规的临床辨证，然后确立治则，再施以相应的治法，选择不同的方剂作为基础来加减。
