首先、胃肠间质瘤主要来源于胃肠道黏膜外的组织这给内镜下切除带来了非常大的困难。其次、胃肠间质瘤无论是采取哪种切除的方式，我们希望不要导致肿瘤的破裂，因为这是导致它复发的关键的因素。但是由于操作的器械或者空间等因素的限制发生破裂的风险比起腔镜或者传统的手术可能略微的升高。此外在进行消化道内镜切除的时候容易发生消化道穿孔等并发症。
首先、胃肠间质瘤主要来源于胃肠道黏膜外的组织这给内镜下切除带来了非常大的困难。其次、胃肠间质瘤无论是采取哪种切除的方式，我们希望不要导致肿瘤的破裂，因为这是导致它复发的关键的因素。但是由于操作的器械或者空间等因素的限制发生破裂的风险比起腔镜或者传统的手术可能略微的升高。此外在进行消化道内镜切除的时候容易发生消化道穿孔等并发症。
人体的组织可以分为上皮组织，间充质组织，胃肠间质瘤是消化道常见的来源于间充质的肿瘤。在1983年以前，没有将胃肠间质瘤和神经源性的肿瘤，肌肉来源的肿瘤，结缔组织的肿瘤之间进行一种很好的鉴别。在1998年，发现了c-kit以及血小板源性生长因子受体的突变是主要病因，目前主要以手术和靶向治疗药物治疗。
胃肠间质瘤的症状没有明显的特异性，尤其是在早期，瘤体的体积比较小，没有一个明显的特异性症状，有一些腹部不适，轻微的腹痛，恶心，反酸，嗳气，当间质瘤长的比较大的时候，会出现压迫症状，食欲减退，进食之后腹部的饱胀感。再有胃肠道间质瘤会出现破溃，便血。
发现胃肠间质瘤就是有手术指征的时候，需要做手术。发现胃隆起性的病变或者肠道的隆起性病变，在有疑问的时候，超过一厘米或者再大一些，建议做手术。做完手术以后，做了病理，明确是梭形细胞或者其他什么来源，称为间质瘤。如果明确，术后可以给进行靶向治疗。
胃肠道间质瘤可不可以治愈，胃肠道间质瘤呢，是具有恶性潜能的肿瘤，短期内看间质瘤通常是良性的，但是随着时间的推移，几乎所有的间质瘤，都会出现恶性的生物学行为，如不断的体积变大，发生转移、术后复发等表现，大部分局限的间质瘤都可以被完全的切除，但是五年后呢，约有半数的患者，会出现相应的临床症状或复发，医生判定肿瘤的复发程度，会根据肿瘤的分级肿瘤大小，手术切缘的干净与否，手术中肿瘤是否破裂，是否合并出血等相关的因素进行判定，术后呢 通常情况下，我们会进行肿瘤评级，中高危组的患者，会进行靶向药物的治疗，来降低肿瘤复发的风险，术后患者需要按照医嘱，进行定期的复查，可以及早的发现复发症状，并且进行及时的手术或者其他治疗，根据肿瘤的复发程度和继发的表现，再决定是否再次手术，或者启用二代或者三代的一个化疗方案，术后按照医嘱进行定期复查，可以及早的发现复发征象，并且能够进一步的进行治疗。
胃肠间质瘤可能是一种可能会出现肝脏或者腹腔播散，以及远处脏器转移的肿瘤如果说不早期发现早期治疗我们可能会丧失手术切除这一种最主要的治疗手段，大大影响了患者总的生存时间此外长在消化道的肿瘤，随着肿瘤的浸润生长都有可能出现消化道出血消化道穿孔以及消化道梗阻的情况，在这种情况下医生处理起来就会非常的棘手，所以我们建议胃肠间质瘤的患者一旦在诊断明确的情况下都能够早期正规的治疗这是减轻患者痛苦减少患者的医疗的花费保证患者疗效的重要手段。
