先天性巨结肠的治疗，最终还是要依靠手术来解决问题，我们叫做巨结肠根治术，在手术之前，往往要采取一些保守治疗的方法，那保守治疗最主要就是通过清洁灌肠，通俗的说就是洗肠，通过洗肠了，是排除大便，而且缓解腹胀，然后再找到一个合适的时候，就是我们家长、医生认为比较合适的时候，先手术治疗，手术治疗的方式比较多，但是就说现在大多数的手术，我们可以经过肛门就可以把这个病变肠管给他切掉，完成这个手术，术后身上看不到任何的伤口，那么现在，还可以借助腹腔镜来完成，使这个创伤减少，也有少数医院现在用，机器人来完成这个手术，这样它的创伤就得更加小。
先天性巨结肠的治疗，最终还是要依靠手术来解决问题，我们叫做巨结肠根治术，在手术之前，往往要采取一些保守治疗的方法，那保守治疗最主要就是通过清洁灌肠，通俗的说就是洗肠，通过洗肠了，是排除大便，而且缓解腹胀，然后再找到一个合适的时候，就是我们家长、医生认为比较合适的时候，先手术治疗，手术治疗的方式比较多，但是就说现在大多数的手术，我们可以经过肛门就可以把这个病变肠管给他切掉，完成这个手术，术后身上看不到任何的伤口，那么现在，还可以借助腹腔镜来完成，使这个创伤减少，也有少数医院现在用，机器人来完成这个手术，这样它的创伤就得更加小。
先天性巨结肠的并发症如下： 第一、小肠结肠炎，患儿出现腹胀、排稀便，恶臭味、呕吐，一旦出现这个症状，家属应及时带患儿来医院治疗； 第二、便秘复发，一般要避免术后应进行半年到一年的扩肛，巨结肠的吻合口有可能出现疤痕性狭窄，如术后2到4周进行扩肛，向吻合口狭窄部分扩开变软，扩开可以避免便秘的发生，减少并发症的出现； 第三、大便出现污粪，污粪就是说大便控制不住，在不自觉或者自觉的情况下流出来。
先天巨结肠这种病是消化道畸形。治疗方法有：一、保守的办法。我们采取灌肠的办法，如塞开塞露、塞肥皂条、用扩肛棒刺激肛门，也可以用生理盐水来灌肠。那么生理盐水灌肠，这个在巨结肠是一个，特殊的灌肠方法，叫回流灌肠，小孩灌肠不能像成人那样，我们就是用一个钢管进去，就是每次打一定量的，生理盐水 再回抽出来，打进去抽出来，要求的是每一次抽出来的，要比打进去的多，另外灌肠的结束的效果的判断是使这个孩子，肚子要软下去 要贬下去，这是灌肠有效的，如果越灌 肚子越胀，就是灌肠失败，这种情况就需要手术来解决，二、手术的办法。手术的方法呢又分好多种，一个就是临时的办法，你比如孩子病情比较重，不允许做根治手术，我们一般就选择造瘘，造瘘的手术，另外就是如果条件允许，那就做根治的办法，一般有四个经典手术上面，又演化出来 有几十种手术办法,那么现在比较先进的运用，腹腔的腹腔镜的办法，就创伤要小一些的办法。
先天性巨结肠又叫先天性无神经节细胞综合征，主要是孩子的直肠或者结肠肠道处于痉挛状态，出现粪便聚集，导致上部的肠管扩张和肥厚。小儿先天性的巨结肠属于先天性的胃肠道畸形，有遗传倾向，在消化道畸形里占第二位，根治治疗以后愈后还是比较好。
先天性巨结肠通常需要以下几个疾病鉴别，第一个就是胎粪栓合症 ，第二个就是胎粪性腹膜炎，第三个还有就是说肠闭锁，第四个通常还要与新生儿坏死性小肠结肠炎进行鉴别，第五个就是甲状腺功能低下。胎粪栓合症主要是就是因为胎粪粘稠，导致这个远端梗阻，这种只要通过观察，把胎粪封排出来以后，这个症状就得到缓解，而且就得到了治疗。胎粪性腹膜炎，就是因为小肠内胎粪堵塞导致肠穿孔，这样的表现是一个急症，肠闭锁是先天肠管是闭锁的，上下不通的，这样的话也是导致腹胀、不排大便的表现，再一个就是新生儿坏死性小肠性结肠炎，往往也是表现为腹胀，腹胀比较明显，还有就是，甲状腺功能低下的孩子，因为也是排便差，也容易与巨结肠进行混淆，那么在里面有几有个病是需要尽快做出鉴别，比如说是胎粪性腹膜炎、肠闭锁，还有坏死性小肠结肠炎，是要这个尽早的明确诊断，比如说胎粪性腹膜炎和肠闭锁需要明确诊断后尽快手术的，所以说是这个鉴别诊断，也是这个非常重要的，但是有时候，也是比较难的。
先天性巨结肠是先天性的肠道发育畸形，也就是有一段肠管、肠神经节细胞缺如。 新生儿时期会出现胎便延迟、腹胀、排便困难、呕吐等症状，如果孩子有胎便延迟、排便困难、呕吐、腹胀，希望到新生儿外科门诊来就诊，到了外科门诊以后，需要做两项特异性的检查，包括下消化道造影和直肠测压。 下消化道造影是从肛门打进去造影剂，通过造影剂的显影，来观察直肠结肠的形态以及造影剂的排泄情况，根据这个基本上就能确诊是否是巨结肠，再结合上直肠测压，绝大部分孩子是可以诊断的。 如果是先天性巨结肠，很小的孩子短期内保守治疗，一个月以后再复查，确是需要手术治疗。先天性巨结肠目前的手术呢绝大部分可以经肛门完成手术。
