孕39周双顶径88mm不会影响智力。通常39周双顶径在86-98mm之间，所以39周双顶径88mm是正常的，不必担心。通常双顶径和胎儿智力没有直接关系，影响胎儿智力的常见原因包括以下几点：
1、遗传性疾病：如近亲结婚或夫妇双方任何一方患有遗传性疾病，可能会影响胎儿智力。因此，建议应避免近亲结婚，对于患有遗传性疾病者，怀孕前应进行遗传咨询。
2、疾病或药物的影响：如孕期病毒感染性疾病或不恰当用药，可能影响胎儿脑细胞发育，而影响智力发育。因此，建议孕期应注意保持个人卫生，避免病毒感染，同时用药应遵医嘱用药，切勿擅自使用药物，以免影响胎儿健康。
3、营养状况：胎儿大脑的发育与功能的建立与营养密切相关，如果孕期蛋白质、叶酸补充不足或缺乏，则会影响脑细胞形成而影响胎儿智力发育。因此，建议孕期一定要均衡饮食。
4、自然环境：如水源污染（重金属汞、铅等）、空气污染（汽车尾气、缺氧、吸烟等）、放射污染（X射线、微波等）、水质缺碘等，也会导致胎儿智力发育障碍。因此，建议孕期应注意远离污染环境。