父子的Y染色体一样。
Y染色体是人类性染色体中的一条，另一条是X染色体。人类有23对染色体，其中22对常染色体男女都一样，性染色体是不一样的且决定性别，女性是XX，男性是XY。父母基因重组产生子代的时候，双方每人给子女一套常染色体，父亲给儿子一条Y，给女儿一条X。Y染色体的遗传遵循的是父系遗传的规律，只能由爷爷遗传给叔叔，父亲，然后再遗传给其各自的儿子，因此只要是同一个爷爷，那么他们的Y染色体分型就一定会完全相同，虽然理论上应该完全一样，但是难免会有突变，但总的来讲父子间的Y染色体依然是极高度相似的。
母亲给子女一条X染色体。线粒体位于细胞质内，因此全由母亲提供（精子没有细胞质）。虽然常染色体决定了遗传的99%以上，父母对子女的影响大致均等，但还是会有细微差异的。Y染色体上最重要的是SPY基因，该基因可以触发雄性发育，对精子的合成至关重要。因此，有Y染色体才能成为雄性。但除此之外，Y染色体就没有其他很重要功能了，它与智力、外貌，性格等重要的特质几乎没有关系。