孕5周咳嗽是否会影响胎儿与具体情况有关，若孕妇咳嗽症状较轻，一般对胎儿无明显影响，但如果咳嗽症状比较严重，或咳嗽由严重的病毒感染引起，就可能会对胎儿造成不利影响。
轻微咳嗽不会影响胎儿，因为胎儿有腹部脂肪、肌肉以及子宫和羊水保护，可以起到很好的缓冲作用，因此不用过于担心。如果是轻度咳嗽，可以通过食疗改善症状，如食用川贝秋梨膏、秋梨白藕汁等，若孕妇咳嗽较重，可能会压迫子宫，如果存在病毒感染，还可能增加胎儿畸形、流产、停育的风险，不利于胎儿的身体健康，建议及时到医院就诊，在医师指导下合理用药治疗，切勿自行服用药物，以免影响胎儿的正常发育。
女性在怀孕期间，尤其是头三个月非常敏感，应注意保暖，尽量避免出现发热、咳嗽症状，且孕妇在怀孕期间服药禁忌很多，滥用药物有可能会对胎儿造成损害，影响胎儿正常生长发育，严重时会造成畸形，因此如果出现了咳嗽、发热等不适，最好还是到医院详细的检查，做血常规、c反应蛋白等检查，明确诊断后，如果有用药指征，就在医师的指导下进行用药。