基因频率改变的原因有突变、选择、迁移和遗传漂移。
具体分析如下：
1、基因突变对改变群体遗传组成的作用有两个方面。第一，它提供遗传变异的最原始材料，没有突变，则等位基因的重组和非等位基因的重组无从发生作用。第二，突变本身改变基因的频率。
2、选择是改变基因频率的最重要因素，也是生物进化的驱动力量。从基因频率改变的方向来看，选择分为2种，一种是淘汰显性个体，它能迅速改变群体的基因频率，使隐性基因频率增加至1。另一种是淘汰隐性个体，使显性基因增加。
3、遗传漂移改变群体基因频率的作用方向是完全随机的。遗传漂移的作用大小因样本群体的个体数不同而异。样本愈小，基因频率的随机波动愈大；样本愈大，基因频率改变的幅度愈小。
4、迁移对群体基因频率改变量决定于迁移率和迁入群体基因频率与接纳群体基因频率之差两个因素。在迁入率一定时，基因频率的变化与两群体基因频率之差成正比。
基因频率是指在一个种群基因库中，某个基因占全部等位基因数的比例。种群中某一基因位点上各种不同的基因频率之和以及各种基因型频率之和都等于1。