鼻窦炎耳朵里面疼可能是形成了中耳负压，也有可能是引发了中耳炎。
1、形成了中耳负压：得了鼻窦炎鼻腔内会产生大量的脓性鼻涕，并且会出现鼻塞、下鼻甲肥大的情况，会对咽鼓管造成刺激，影响通气。而咽鼓管与中耳是相通的，如果不及时治疗鼻窦炎，咽鼓管通气变差，会对中耳造成压迫，从而形成中耳负压，就可能会出现鼻窦炎耳朵里面疼的情况。
2、引发了中耳炎：鼻窦炎主要是炎症刺激引起的，长期得不到缓解会引起其他的并发症，比如咽喉炎、上呼吸道感染、中耳炎等，如果鼻窦炎感染引发了中耳炎，会出现耳朵里面疼的症状，需要做耳内镜检查进行确诊。
鼻窦炎耳朵里面疼如果不明原因，不能够擅自用药，需要及时到耳鼻喉科配合医生做相关检查，比如鼻内镜、鼻窦CT、耳内镜检查等，根据检查的结果，查找出具体的病因后，采用对症的方案进行治疗。如果鼻窦炎比较严重，需要考虑行鼻内镜手术治疗，同时还需要使用消炎的药物，比如罗红霉素、头孢克肟等，以消除局部的炎症。