首先要和上气道疾病进行鉴别，上气道咳嗽综合症、鼻炎、咽炎喉炎造成的咳嗽，第二是过敏性疾病，包括咳嗽变异性哮喘进行鉴别，第三肺本身的疾病，包括肺结核、特发性肺间质纤维化、肺炎支气管肺癌等还要和消化系统类疾病比如反流性食管炎，以及药物引起的咳照进行鉴别。
首先要和上气道疾病进行鉴别，上气道咳嗽综合症、鼻炎、咽炎喉炎造成的咳嗽，第二是过敏性疾病，包括咳嗽变异性哮喘进行鉴别，第三肺本身的疾病，包括肺结核、特发性肺间质纤维化、肺炎支气管肺癌等还要和消化系统类疾病比如反流性食管炎，以及药物引起的咳照进行鉴别。
慢性咽炎容易和气道敏感性咳嗽、胃食管反流性咳嗽等疾病混淆。呼吸系统30%-40%的病人有咳嗽症状，有很多会被误诊为慢性咽炎。病人可能有其他病因，若肺上没有病灶、结核、肿瘤、质扩等疾病，就要考虑气道敏感性咳嗽、胃食管反流性咳嗽、鼻后滴流综合症的咳嗽、上气道综合症咳嗽、感冒后咳嗽，所以这几类疾病要去鉴别诊断。
慢性胆囊炎主要表现为消化不良和腹痛。首先右上腹痛，除了慢性胆囊炎，胃病、十二指肠疾病，还有肝病，都是在这个地方，甚至带状疱疹、胸膜疾病都有可能发生右上腹痛。慢性胃炎，甚至慢性胰腺炎也会有消化不良的症状，这些都可以跟它一块鉴别。
因为心包炎会造成心包积液或者造成心脏的扩张的受限，会出现一些类似于心衰的表现。比如说有的人会出现全身肿，出现脖子静脉的曲张很严重，然后脸也肿，浑身都是水，吃不下饭，胃肠道瘀血，也会出现一些肺水肿的一些表现。它的表现非常的像心衰出现的这些表现，心衰也会出现类似的这些表现，所以我们经常是通过客观检查去发现有没有心包的问题的。比如说我们照X线，做心脏CT 做心脏核磁或者做心脏的心脏彩超来鉴别，到底是心肌本身出了问题还是心衰还是心包出了问题。
在临床上诊断焦虑症，首当其冲的要和甲状腺功能亢进这个病来相互鉴别，因为焦虑症的这些临床表现，包括精神上担忧、紧张，包括失眠、睡眠障碍、还有躯体上的植物神经系统，包括心内科的、心血管系统的、消化系统的、内分泌的、骨骼肌肉的、皮肤系统等等都有，然后还有一个运动性的，包括一些行为坐立不安、手抖或者说话颤抖，这些都是骨骼症状，都是这些表现，而这些表现，某些躯体疾病也可以出现这些症状，比如甲亢，因此要和甲亢首当其冲的要鉴别，第二要和心脏心脏系统疾病要相互鉴别，因为有一些焦虑障碍本身就是胸闷、气短、心悸，心脏这些为主诉的，因此这个时候，也要和心脏疾病相互鉴别。消化系统的疾病相鉴别，如焦虑患者会出现恶心、呕吐。还要和泌尿系统的疾病相鉴别，焦虑患者会有尿频尿急的情况。
宫颈炎症状相似的疾病有阴道炎、子宫颈癌、盆腔炎相混淆。宫颈炎最常见的症状就是白带增多，会刺激外阴，出现外阴不适或者尿频等症状，同时它也会出现经间期出血、同房出血状，严重的子宫颈炎还会出现小腹不适、腰骶部酸痛。
