人们对胃肠道间质瘤的认识相对是比较晚的，大概在上个世纪80年代90年代以后。在认识这个肿瘤之前，多数的胃肠道间质瘤被诊断成各种各样的肿瘤，比如平滑肌瘤，神经鞘瘤等等。这个肿瘤细胞多数呈梭形的，少数的呈上皮样的。形态上看跟平滑肌瘤，神经鞘瘤都比较像。所以对肿瘤认识之前就常常诊断出平滑肌瘤，神经鞘瘤等。特征性的免疫组化是表达CD117，DOG-1以及CD34。在诊断胃肠道间质瘤之后，病理医生会通过肿瘤的大小，发病的部位以及和分类上的多少将胃肠道间质瘤的危险程度分为极低、低、中等、高4个等级。不同等级的危险程度的间质临床治疗的策略是不同的。在诊断胃肠道间质瘤之后，一般认为没有纯粹良性的胃肠道间质瘤，至少是一个极低恶性程度的肿瘤。

骨肉瘤是最常见的骨的原发的恶性肿瘤。发病的年龄比较小，最常见的是10岁到20岁。有一部分病人是和外伤有关的，比如曾经受过车祸，或是在运动当中不小心磕过碰过，但也不是所有都和外伤有关。最常见的发病的部位是在膝关节的上下，也就是股骨的下段和胫骨的上端。在老年人也可以发生在非经典的部位，比如比较小的骨头，颌骨。临床上主要是表现为局部的肿块还有疼痛，自己能摸见。患者常常自己能摸见的膝关节周围会长成一个大肿块，影像学上有比较明确的诊断的指针。典型的骨肉瘤放射科医生通过影像学就可以做出比较正确的诊断。骨肉瘤的治疗原先更多的是需要靠节制的，因为是高度恶性的肿瘤。但是现在通过化疗之后的手术综合治疗手段，保值率是越来越高的。骨肉瘤有个很不好的特点就是即便是经过化疗和手术还可以发生远处的转移，特别是肺转移。

骨肿瘤诊断要临床、影像、病理三结合。骨肿瘤最常见是骨软骨瘤。这是发生在四肢的长骨的表面的，是隆起性的病变，是良性的。再一个比较常见的就是软骨瘤。软骨瘤多数是发生在手，脚，指骨，还有涨股的里面，是良性肿瘤。还有纤维结构不良。纤维结构不良也是发生在髓腔的界限清楚的良性肿瘤。恶性的骨肿瘤比较常见的是骨肉瘤以及软骨肉瘤等。骨肿瘤诊断时单纯靠病理比较困难，所以在诊断的时候强调的要临床、影像、病理三结合，病理医生不仅要看病理切片，也要结合患者临床的表现以及影像学的检查，特别是影像学的检查对诊断骨肿瘤是非常重要的。所以有的医生如果不看影像学片子就不做出骨肿瘤的诊断。提醒患者如果是来做骨肿瘤的病理会诊的时候，除了要带病理切片外还要带影像学的片子，带的越全越好，包括普通的x光片、CT、磁共振。就是只要做过的都要带过来，结合起来才能得出比较准确的诊断。

骨肿瘤指的是骨或是转骨原发性的肿瘤，主要是骨肿瘤。骨肿瘤原发的骨肿瘤不是太多见，临床上骨头上更多见的肿瘤都是一些原转移性的肿瘤。比如乳腺癌、前列腺癌、肺癌等等。这些原发脏器发生的肿瘤转移到骨，这时候称为骨的转移瘤，而不成为骨的骨肿瘤。就是说不是骨的原发性的肿瘤。此外还有一种比较特殊的情况，就是多发性骨髓瘤。多发性骨髓瘤虽然也是原发在骨的，发生在骨髓当中，但本质上不是骨的肿瘤，而属于淋巴造血系统的恶性肿瘤，也就是常说的多发性的浆细胞性骨髓瘤。骨的原发性的肿瘤一般是指比如良性的骨软骨瘤，软骨瘤等。恶性的比如骨肉瘤，软骨肉瘤等。

软组织肿瘤病理诊断具有相似性。软组织肿瘤的病理常常是对于病理医生来说有很大的挑战性。因为其是形态学，还有免疫组化，有很多重叠的地方。也就是说，不同的肿瘤可能有相似的形态学的表现，以及相似的免疫组化的表型。免疫组化需要判断肿瘤的分化方向，还需要结合临床以及影像学的资料，找到肿瘤发生的具体的部位以及和周围组织的关系。多数情况下良性的肿瘤和周围的关系界限比较清楚，恶性的常常是浸润性的生长或者是压迫性的生长，这对判断良恶性是很有帮助的。此外除了免疫组化在软组织肿瘤当中需要用以外，分子检测在软组织肿瘤诊断方面也越来越重要。比如诊断腹膜后的高分化脂肪肉瘤，常常用MTM2基因是否有扩增来判断。如果是阳性的结果，对于诊断高分化脂肪瘤或者去分化脂肪肉瘤是非常有帮助的。