跖疣没有直接的自愈方法。
跖疣属于人乳头瘤病毒感染导致足底部病变，和长期的站立、走路、局部的摩擦、身体的免疫能力下降有直接关系。这种病毒感染有可能会导致局部组织的免疫力下降，会导致感染面积增大，有的会出现局部肿胀疼痛的感觉，有的没有任何自主不舒服的症状。跖疣不治疗一般不会自愈。通常需要根据患者具体病情，进行针对性治疗。
通常如果患者跖疣数量较少，且面积不是很广，则可以进行局部治疗。比如使用水杨酸软膏或腐蚀性药物，如鬼臼毒素。也可以通过物理治疗方法治疗，比如冷冻、二氧化碳激光治疗、电解、电灼等。
如果患者跖疣数量较多，病变面积较大，则需要进行系统治疗，比如进行免疫调节的治疗，吃药、打针、胸腺肽、左旋咪唑，甚至有时候进行抗病毒的治疗，大部分的疣体能够消除。如果治疗效果不理想，也可以使用光动力方法治疗，随后涂抹光敏剂配合治疗。