脚上长跖疣可以通过药物治疗、物理治疗以及手术治疗的方式来达到根治的效果。具体的治疗方式需要根据病情的严重程度而定。
1、药物治疗：如果脚上长跖疣的症状比较轻，可以在医生的指导下，涂抹免疫调节类以及抗病毒类的药膏来进行治疗，比较常用的药膏有咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏，同时也可以口服匹多莫德口服液，还有胸腺肽肠溶胶囊等药物来缓解症状，有可能达到根治的效果。
2、物理治疗：如果病情较重的情况下，通过药物治疗的方式可能并不能达到完全清除病毒的效果，也可以通过液氮冷冻技术把局部的病毒细胞直接消灭，能够达到根治的效果。同时也可以通过微波热凝技术来阻止身体给疣体提供的营养缓解病情。但是一次治疗并不能彻底去除，可能需要多次治疗才能够达到根治的效果。
3、手术治疗：如果病情特别严重，通过药物和物理治疗的方式并没有达到根治效果，也可以去正规医院，通过手术的方式彻底的切除病灶，来达到完全治愈的效果。
在患病治疗期间要做好局部的清洁和卫生，同时尽量减少脚部活动，避免摩擦。