微生态菌群异常是否严重，要根据患者的具体情况而定。
如果患者平素体质较好，则可能会出现轻微的微生态菌群异常，常表现为腹泻、便秘、腹痛、胀气等。大多数人通过适当饮食和生活方式改变，就可以来缓解这些症状，如增加膳食纤维摄入量、多吃酸奶等富含益生菌的食物。
但是如果是免疫系统失调，或患有某些慢性疾病的人，出现微生态菌群异常，则是比较严重的，通常需要通过更加专业的医疗手段来治疗微生态菌群异常，如使用益生菌、预生物质、粪菌移植等方法。
1、益生菌：可以直接补充肠道内的益生菌，帮助恢复肠道微生态菌群。
2、预生物质：可以提供营养，促进益生菌生长和繁殖，帮助平衡肠道微生态菌群。
3、粪菌移植：是一种非常有效的治疗微生态菌群异常的方法。该方法通过将健康人的粪便中的微生物群落移植到患者的肠道内，恢复肠道微生态菌群的平衡。粪菌移植主要适用于慢性肠炎、肠易激综合征、抗生素相关性腹泻等疾病的治疗，但由于该方法存在风险，只能在严格的医疗条件下进行。