粪便基因检测阳性通常是指患者大便样本里面存在病毒基因片段或者病毒，一般代表患者存在消化系统相关的疾病，包括溃疡性结肠炎、肠道肿瘤等。
粪便基因检测主要是通过对粪便中的血细胞进行检测，属于临床上检测肠癌的一种新型筛查手段。若检查结果显示为阳性时，首先考虑患者存在消化道疾病，比较常见的为溃疡性结肠炎，由于炎症刺激造成消化道出血，当血液掺杂在粪便中，可出现阳性结果。但患有肠道肿瘤的患者，因粪便中含有大量从肠道肿瘤表面脱落的异常增生细胞和细胞成分，所以，当此项检查结果为阳性时，还要排除是否存在肠道肿瘤。
因此，当上述结果为阳性时，建议患者进一步通过肛门指诊、肠镜检查、全腹部CT检查，来明确具体的原因，并采取针对性处理措施。