喝水跑步肚子疼可能是受风着凉、肠胃痉挛、胃肠炎等原因引起，需要遵从医嘱进行用药。
1、受风着凉：跑步前喝水会吸入冷空气，可能会导致胃肠受凉，引起肚子疼痛，应该及时停止跑步，采取局部热敷和按摩等方式来缓解。
2、肠胃痉挛：喝大量水后进行运动会导致胃部膨胀，引起胃肠功能紊乱，形成肠胃痉挛，可以在医生指导下口服莫沙必利胶囊、颠茄片等药物进行治疗，能够促进肠道气体排出，起到解痉止痛效果。
3、胃肠炎：跑步的时候经过出汗会导致体温上升，跑步前喝凉水可能会对肠胃相当刺激，引起急性胃肠炎，可以在医生指导下口洛哌丁胺片、氟哌酸胶囊等药物进行改善。
除上述原因外也不排除是食物中毒等所引起，通常是饮水不卫生，可以到医院进行相关检查。