IgA肾病切除扁桃体并没有最佳时机，如果患者反复出现扁桃体炎且保守治疗无效，则可以择期切除扁桃体。
IgA肾病是我国最常见的慢性肾炎类型，也是导致尿毒症的主要原因之一。它会导致患者肾功能下降，出现水肿、蛋白尿等不适。
对于一些反复发作的慢性扁桃体炎或者因扁桃体炎引起的肉眼血尿的IgA肾病患者，切除病灶扁桃体可以清除在扁桃体隐窝里繁殖的感染细菌病原体，减轻体内的免疫反应，降低患者异常IgA分子，从而减轻IgA肾病的临床表现。
因此，对于反复出现扁桃体炎且保守治疗无效的IgA肾病患者，可以在医生指导下择期进行手术。