单纯HPV感染一般需要治疗，以免出现寻常疣、尖锐湿疣、肛门癌、宫颈癌等疾病。
单纯性的HPV感染是指感染了人乳头瘤病毒，大致可分为低危型和高危型。皮肤低危型感染包括HPV1、HPV2、HPV7、HPV10等，会引起皮肤出现寻常疣、跖疣等皮损，黏膜低危型包括HPV6、HPV11、HPV13等，会引起生殖器及肛门、食道粘膜出现病变。皮肤高危型感染包括HPV5、HPV8、HPV14等，与外阴癌、阴茎癌以及肛门癌等疾病有关，粘膜型高危感染包括HPV16、HPV18，有引起宫颈癌、口腔癌的风险。
由此可见，无论是高危型还是低危型的HPV感染，都有引起病变的可能，所以都需要进行治疗，常用治疗包括物理治疗（液氮冷冻、激光治疗、微波射频等）、药物治疗（5%咪喹莫特、氟尿嘧啶软膏等）以及提高免疫力治疗（干扰素、胸腺肽等），需要在医生的指导下进行选择。