治疗幽门螺杆菌的药主要是四联用药，即质子泵抑制剂、一种铋剂、两种抗生素，能够起到较好的消炎作用，可以防止幽门螺旋杆菌繁殖，对于疾病的治疗可以起到较好的效果。
幽门螺旋杆菌感染的几率比较高，达40%以上，但是想要根除幽门螺旋杆菌的难度是比较大的，一般需要选择四联用药的方式治疗，所谓四联用药，则是选择4种药物联合应用来治疗，能够达到根除幽门螺旋杆菌的作用。4种药物分别是质子泵抑制剂、一种铋剂、两种抗生素等，质子泵抑制剂主要使用奥美拉唑、埃索美拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑、兰索拉唑等；铋剂主要有果胶铋、丽珠得乐等，两种抗生素主要包括阿莫西林、四环素、呋喃唑酮、克拉霉素、甲硝唑以及喹诺酮类药物。对阿莫西林药物过敏的患者可以选择四环素来进行代替。
幽门螺旋杆菌治疗的疗程通常在10~14天，如果患者没有明显的不适症状，治疗的周期会相对缩短，一般10天就能够很好的控制病情，但是14天能够保证细菌被有效的根治，所以需要按时服药，并且停药4周之后进行复查。