孕早期肛门痛一般是不会影响孩子的。肛门痛需要及时的了解原因，然后对症治疗，可以使病情快速的得到缓解。
孕早期肛门痛可能是由于长时间的久坐、不规律的饮食、便秘等因素所导致的，另外也可能是痔疮的因素所引起，在发病以后就有可能会导致肛门的部位出现刺痛感，同时还会伴随着肛门部位肿胀和疼痛，对于痔疮发生以后，还会导致肛门出现便血的症状。出现这些疾病以后及早的治疗通常是可以使病情得到缓解的，是不会影响到孩子的生长和发育。一般需要及时的改善不良的饮食，可以适当的吃些粗纤维的瓜果和蔬菜，能够促进胃肠道的蠕动，缓解便秘的症状，也可以使自身得到缓解，另外也可以通过温水坐浴的方式来缓解。孕妇属于一个特殊的体质，尽量不要口服药物，以免对胎儿的生长发育造成一定的影响。
在怀孕期间患者也要保持愉快的心情，避免过度的焦虑和紧张，定期到医院做腹部超声的检查，及时的了解胎儿的发育情况，怀孕早期是胎儿的生长发育关键期，要避免过性生活，可以适当的补充叶酸，预防胎儿出现神经管畸形。