骨囊肿是否会自己消失，需要根据身体状况以及病情严重程度判断。
1、身体状况：如果身体状况比较好，有一定的抵抗力，骨囊肿有可能会自己消失，但如果个人身体状况比较差，抵抗力也会比较弱，骨囊肿消失的可能性就会比较小。
2、骨囊肿病情严重程度：骨囊肿是一种良性瘤样病变，发病人群主要以儿童、青少年为主，其好发部位在掌骨的干骺端，骨囊肿在生物学行为上有自限性，所以部分患者在患病后如果并不严重，一般是可以消失的，但也有大部分病情严重的患者，病情发展速度快，会随着囊肿的增大，会出现病理性骨折以及畸形等不良现象，则不会自行消失，
当患有骨囊肿后要密切观察病情，如果病情严重，建议及早的到当地正规的医疗机构，配合专业的医师，采用手术的方法来进行治疗，以免延误病情，给身体带来不利的影响。
治疗期间一定要注意多休息，饮食上不要吃一些辛辣类的食物。