甲功抗体二项是指甲状腺球蛋白抗体和甲状腺过氧化物酶抗体。
甲状腺球蛋白抗体是血清中糖蛋白的一种，是针对甲状腺球蛋白而产生的抗体。甲状腺球蛋白抗体正常人血液中没有或含量很低，当患有甲状腺免疫性疾病时含量增加。一般产生此种抗体，可造成甲状腺功能减低，并且会影响甲状腺球蛋白的检测结果。
甲状腺过氧化物酶抗体又称TPO抗体，在T3与T4生物合成过程中催化甲状腺球蛋白、酪氨酸的变化。TPO与自身免疫性甲状腺疾病的发生发展密切相关，可根据TPO水平对桥本甲状腺炎、自身免疫性甲状腺机能亢进、中毒性弥漫性甲状腺肿等疾病进行诊断与监测。甲状腺过氧化物酶抗体在血液中的正常值一般要求在30u/ml之内，当数值出现明显升高时，多数是因为甲状腺存在异常，由自身免疫异常而导致。
甲状腺过氧化物酶抗体与甲状腺球蛋白抗体的升高，是判断原发性甲状腺功能减退症病因，以及诊断自身免疫性甲状腺炎的重要指标。甲状腺过氧化物酶抗体阳性，血清促甲状腺激素水平升高，常提示甲状腺细胞受损。