龙胆紫溶液将染色体染成紫色。
染色质或染色体容易被碱性染料染成深色。实验中对染色质或染色体进行染色，须使用龙胆紫溶液或醋酸洋红溶液等碱性染色剂，这些染色剂是以龙胆紫或醋酸洋红溶解于醋酸溶液中制得，染色剂的界定并非由染料溶液的pH值决定的,而是根据染料物质中助色基团电离后所带的电荷来决定，龙胆紫溶液配制后的龙胆紫溶液pH值约小于7（呈酸性）。
龙胆紫染色剂作为染色剂必须具备两个条件：
一是具有颜色；二是要与被染组织间有亲和力。染料的颜色和它与组织间的亲和力是由染料本身的分子结构决定的，产生颜色的发色基团和与组织间产生亲和力的助色基团共同决定了染色剂的染色性质，龙胆紫溶液只能与碱性的相结合,在染色体中为碱性的是氨基,所以可染DNA。
其次，作为染料物质，除了有发色基团外，还需要有一种使化合物发生电离作用的助色基团。如染料化合物中往往由硝基等形成了发色基团，而酸性基团和碱性基团构成了助色基团。存在使染料物质离子化，极性增强，促进染料与组织间发生作用，产生染色效果。我们把助色基团中具有酸性或碱性基团的染料分别称为酸性或碱性染色剂。