一般情况下，肠镜的严重并发症，包括肠道准备，所引起的水电解质失衡，穿孔腹膜气肿，发热全身不适，延迟性穿孔出血，延迟性出血，肠黏膜、浆膜层、肠壁撕裂、脾或肝脏受损，肠系膜损伤，肠系膜栓塞、脾破裂、肠绞痛、麻痹性肠梗阻和心脑血管意外及麻药过敏等情况。结肠镜检查的禁忌症很少，有多属于相对禁忌，如妊娠期可以导致流产和早产，急性腹膜炎有可疑穿孔等，可导致炎症扩散。做肠镜对身体有危害，但是这些危害是可以逆转的。
做肠镜后饮食注意事项
如果手术切除局部的息肉创面比较大有的人可能需要禁食1天以上的，然后在饮食方面才能慢慢的喝一些水，再吃一些流质的食物，不论是普通肠镜或者是无痛肠镜在以后的饮食当中，都要尽量不吃辛辣的冷的东西，不能饮酒，不能吃硬的，只有注意到这些才可以恢复的更好一些如果腹胀明显，或者伴随疼痛，甚至是疼痛加重，应尽快的入院，急诊检查，主动告知医生曾做过肠镜检查，并说明有无进行活检等操作。做肠镜以后如果患者没有取病理活检，那么饮食上就不需要做太多的注意，可以正常的饮食没有关系。
做肠镜挂什么科
照肠镜一般是挂消化内科或者是胃肠科，上述科室的医生一般会详细的询问病史，查体，必要的时候可能还需要进一步做心电图，腹部彩超，CT等相关检查，评估患者具体的病情以后，才给予开具肠镜的申请单，最后在消化内镜中心预约肠镜检查。做肠镜需要挂消化内科，肠镜是对整个大肠进行了检查并且还可以观察一小段回肠末端，做肠镜之前需要口服泻药，将肠腔内的粪便排泄出来，才能有利于肠镜的观察。做肠镜挂消化科，就是先到挂号处挂消化科的号，然后到门诊找消化科医生开肠镜申请单，交费之后再去检查预约中心预约检查时间。