颅底凹陷症能活多久不能一概而论，需要根据患者的不同病情而定。如果患者病情较轻，一般不会影响其寿命，如果患者病情较重，则可能会缩短患者的生存时间。
颅底凹陷症是枕骨大孔周围的颅底骨向上陷入颅腔，迫使其下方的寰枢椎（齿状突）升高进入颅底，可合并部位的其他骨发育异常（如椎体分节障碍、寰椎融合障碍），并可合并神经结构畸形（如小脑扁桃体下疝和脊髓积水等），这些畸形可见于30%的颅底凹陷患者。颅底凹陷症症状主要包括几大方面：
第一、小脑受到压迫以后导致的一些症状，比如头晕、走路不太稳、精细动作协调不好等。
第二、后组颅神经受到牵拉受到压迫的症状，主要包括吞咽困难、饮水呛咳、声音嗓音变得沙哑、阵发性干咳等。
第三、上部的颈髓和延髓受压迫的症状，主要会导致肢体的感觉异常和运动功能障碍，还有肌肉的萎缩等。
颅底凹陷症一般需要通过手术的方法治疗，控制病情的发展，如果及时处理，一般并不会直接危及患者生命，但有可能会引起脑组织损伤，从而产生神经功能障碍的后遗症，会对日常生活造成一定的负面影响。此时可以结合应用营养神经的药物促进恢复，后期要注意定期进行复查，防止出现并发症。如果患者出现症状不及时处理，则可能会影响其生存时间。