胎儿畸形一般在怀孕前三个月形成。
一般来说在此时期胎儿器官分化基本完成，很多畸形往往都是在此期间形成的，但是想通过检查发现，需要注意检查时间。早期超声可以发现无脑儿等畸形，而脑积水，肾盂积水，多囊肾，心脏畸形等则需要妊娠晚期的超声检查，而有些甚至需要磁共振检查才能发现畸形。
女性妊娠12周之内若接触不良物质或者未注意而使用某些特殊药品，就有可能导致胎儿畸形的风险性增加。特别是用孕6至12周之间，这个阶段正是细胞分化时期，也是各个组织器官初步分化形成阶段，此时期是胎儿畸形易形成的危险阶段。
随着孕周增加，女性步入孕12周后的细胞分化已完成，此阶段是各个组织器官发育生长期，从而也会使胎儿致畸的可能性降低。胎儿畸形也是一个逐渐生长发育的过程，所以各孕周都要做好针对性的产前检查。
在孕22到24孕周要通过B超排查畸形，在孕26周时还要再进行一次复查。对发现严重的畸形胎儿时应为优生优育考虑，也要及时作出处理。
由此可见，胎儿的畸形常在孕早期阶段形成，因此，女性怀孕之后的初期阶段一定要注意，不应随意使用一些药品，对有辐射或有毒有害物质较多的场所避免接触，以保证胎宝宝可以更好的健康发育。