脑脓肿后遗症最多的是因为神经局灶性的病变，把正常的脑组织破坏，从而形成一系列的神经损害症状。若是非功能区出现损害，患者会有长期头疼的症状，随着是时间的推移还会出现癫痫、抽风的表现。脑脓肿是由于外界细菌进入颅内，引起急性发作良性的病变，早期来达到治愈的目的。中晚期可以进行微创的或者开颅的手术，脑脓肿患者多数是可以治愈的。
脑脓肿晚期
脑脓肿治疗应尽可能将感染灶彻底清除，同时全程抗生素治疗，才能获得较高的治愈率。外科治疗需结合其它全身治疗，如抗生素治疗、减轻脑水肿治疗、全身营养支持治疗等，较之前脑脓肿的治愈率有明显提升，临床多数患者通过系列治疗后，疗效较好。脑脓肿治疗过程中的并发症与侵犯的功能区相关，可引起偏瘫、失语、神经功能障碍、神经功能缺失。脑脓肿晚期多依据脓肿部位、发展时期，而采用不同的外科治疗手段。
脑脓肿复发率
脑脓肿属于容易复发的疾病，一般来说抗生素治疗不规范，手术切除感染病灶不彻底，脑脓肿的脓腔残留、隐形脓肿存在等等都是导致容易复发的原因，另外入院时患者的意识水平以及并发症、身体素质也是影响脑脓肿复发的因素，所以在治疗中应当适当的延长抗生素的治疗时间，这种情况对复发也是有预防作用的，同时，要加强手术的管理，积极处理原发灶，这样才能尽最大可能减少复发。