免疫组织化学检查是一门新兴技术，已被广泛运用于肿瘤研究和诊断。原理是利用抗原与抗体的特异性结合来反应检测组织中的未知抗原或抗体，主要是肿瘤相关抗原、肿瘤分化抗原、肿瘤胚胎性抗原。帮助诊断肿瘤的来源和分化程度，协助肿瘤的病理和鉴别诊断。染色的方法有PAP法和ABC法，可对多种常规方法难以判断其来源的肿瘤加以鉴别。如检测细胞骨架的中间丝其直径，平均直径均为10个纳米，介于微管、微丝之间。中间丝分为五类，即神经纤维、胶原纤维、结蛋白、波形蛋白、角蛋白。其各有生物学和免疫学特性，存在于不同类型细胞中，具有相对特异性，可用其相应的抗体来协助诊断相应的神经细胞、神经胶质细胞、横纹肌、平滑肌、间叶组织以及上皮细胞来源的肿瘤。利用激素和激素受体的特异性结合可对乳腺癌等激素依赖性肿瘤、雌激素受体、孕激素受体的水平进行免疫组化检测，指导临床治疗。雌激素受体阳性者对于内分泌治疗的效果好，预后优于受体阴性病人。

免疫组化的优点是特异性好、敏感性高、简便快速、费用相对低廉、重复性较好，缺点是不全面。免疫组化跟费用的低廉主要是相对于分子检测来讲的。分子检测一个项目大概就要上千块，免疫组化的一个项目大概只要100多块钱。但是免疫组化在所有应用的抗体当中没有一个抗体是足够敏感和足够特异。这样就要求在制作免疫组化的过程当中用一组抗体来综合判断肿瘤的性质，单靠一个或者是两个抗体就会出现偏差。免疫组化在实验的过程当中会有很多不可控的因素，比如说一抗的选择，二抗的时间长短以及显色时间的长短。这就会造成免疫组化结果的不稳定。对不同的实验室之间也会造成免疫组化的结果不同或者甚至相反。免疫组化虽然能帮助病理医生诊断疾病，但还应该更客观和更全面以及综合的来判断免疫组化的结果。

首先第一点免疫组化检查，可以协助诊断恶性肿瘤，或者是进行恶性肿瘤的鉴别诊断。第二点，通过免疫组化检查，可以诊断出一些转移性肿瘤，它的原发部位在哪里。第三点，免疫组化检查，对于软组织肿瘤的诊断和鉴别诊断，以及分析有十分大的帮助。第四点，通过免疫组化检查，有的时候可以发现一些微小的转移灶。发现微小转移灶的目的，可以协助临床，制定下一步的治疗方案，或者是选择手术范围。最后一点通过免疫组化检查，为临床医生，提供治疗方案的选择。通过这些免疫组化标记物，临床的治疗方案，可以有多种的选择。需不需要做内分泌治疗，需不需要做靶向治疗，这样能给患者带来更好的预后。

鉴别分型，为治疗提供依据，为靶向治疗提供靶点检测，推测肿瘤基因异常四种情况要做免疫组织化学染色判断。 免疫组化有以下几方面的作用：第一，鉴别肿瘤分型。不同肿瘤分型不同治疗方式不同。比如肺的鳞癌和腺癌的鉴别化疗不同。比如淋巴瘤，不用免疫组化没有办法做出准确的诊断及分型。对应的几十个不同类型的淋巴瘤临床治疗的方式也不同。第二，为肿瘤的治疗提供依据。比如雌激素或是孕激素，受体阳性的乳腺癌可以用内分泌治疗。受体阴性就不适合用内分泌治疗。胃常道间质瘤如果是CD117阳性的，适合用伊马替尼治疗。比如免疫治疗，需要PD-L1的免疫组化检测来确定肿瘤对药物的敏感性。第三，为靶向治疗提供靶点的检测。比如HER-2受体阳性的乳腺癌或者是胃癌适合用曲妥珠单抗的治疗。ALK阳性的肺癌适合用克唑替尼治疗。第四，通过免疫组化来推测肿瘤基因异常的状态。比如对错配修复蛋白的免疫组化检测来推测肿瘤是不是存在基因组的微卫星不稳定性。