首先是通过病理医生，利用自己的病理学知识 以及理论的经验，对送检的标本进行取样。选择有典型的诊断价值的区域进行取样，病理医生通过显微镜，对切片内的组织结构，细胞形态进行分析识别。同时还要结合大量的临床信息，包括患者的临床病史如何，影像学的表现如何综合判定，得出病例的诊断结果，极少数病例需要进行免疫组化标记分子检测，才能得出最终的正确的结果。

痰液的检查是明确肺结核诊断重要的一种检测手段，根据痰标本采集的时间分成三大类痰标本：第一个是即时痰，病人就诊时深呼吸以后咳出来的痰，第二晨痰就是清晨晨起用清水漱口以后咳出来的第二口和第三口痰，第三种痰液是指24小时痰，也就是说送痰的前一日到送痰，当日收集起来的全部的痰液。正确留取痰标本的方法，包括有病人留取痰标本前，是需要用清水漱口，去除掉口腔的食物残渣。如果患者有假牙，应该摘掉牙托，患者需要在做数次的深呼吸以后，收腹用力地咳出，来自于支气管深部的脓样的或者是粘液样的痰，痰的量不少于3毫升，对于一部分没有痰或者是少痰的患者，医务人员可以采用浓盐水雾化刺激排痰的方式，诱导排痰避免留取唾液，鼻咽部的分泌物，上述分泌物会减少结核菌的检出机会还有留取痰标本的时候，要使用专用的痰标本盒并且及时送检，留取24小时的痰标本的时候，应该要注意盖住容器，避免交叉污染。

通常所说的病理切片实际上是病理医生可以在显微镜下直接进行观察的，它是组织块。手术的标本是临床医生通过手术或者是一些局部的操作，从病人身上取下来一块组织，这个组织经过病理科的整个的一个登记，然后之后取材、脱水，整个流程、包埋，然后之后整个制片流程处理之后，直接包到一个蜡块里边，这是一个组织块。标本和切片实际上本质是一样的，只不过在病理科，会把临床医生送给我们的标本，找到典型的部位，取材之后制成这种蜡块，之后再进行切片，实际上标本和切片在本质上是一样的，是相同的。

系统性红斑狼疮的主要病理学免疫学检查包括：一、抗核抗体95%为阳性，但可呈假阳性，阴性也不能排除系统性红斑狼疮，特异性约为65%二、抗双链DNA抗体，65%为阳性，特异性约95%。三、抗SM抗体，阳性率30%，几乎为系统性红斑狼疮所独有，成为系统性红斑狼疮的标记性抗体。四、血液补体减低，免疫复合物阳性。五、皮肤狼疮带实验，阳性率为70%。六、肾活检，常见的病理类型为弥漫增殖型、膜型、系膜增生型、局灶增殖型和小管间质性。