不同的情况进行不同的处理：
一、因为囊肿里面都是水、积液等液体，在手术过程中囊肿可能会破，破了以后就不好找，所以，结膜囊肿手术有时候不能完全切除，可能会残留一些上皮组织或囊壁组织，这时候结膜囊肿容易复发；
二、但有时，即使结膜囊肿手术完全切除了，也会因长期用眼过度、风沙进入、熬夜或揉眼等原因使结膜囊肿复发。
不同的情况进行不同的处理： 一、因为囊肿里面都是水、积液等液体，在手术过程中囊肿可能会破，破了以后就不好找，所以，结膜囊肿手术有时候不能完全切除，可能会残留一些上皮组织或囊壁组织，这时候结膜囊肿容易复发； 二、但有时，即使结膜囊肿手术完全切除了，也会因长期用眼过度、风沙进入、熬夜或揉眼等原因使结膜囊肿复发。
影响外观的；有不舒服感的、会充血的；大的囊肿；以上有其中一点的就可以做手术。小的、不影响外观的、看不出来的、对患者的生活没有任何影响的，满足这种情况的不需要做手术，可以保守治疗、观察。
结膜囊肿出现以后只要能保证充足的休息，减少用眼次数，正规用药等，结膜囊肿尤其是小的结膜囊肿，即使不手术一般不会变大发展。 但是，出现结膜囊肿以后，还有经常熬夜，吃的比较油腻，用眼过度，睡眠不好，着急上火等情况，囊肿就会变大发展。
从症状上来说，结膜囊肿是在眼睛的结膜上有一个亮亮的白色的水泡，旁边充血，有时眼睛会有异物感，有不舒服，但是对视力没有影响。 结膜囊肿根据病因有两种：一种是因炎症、用眼过度等刺激或淋巴系统堵塞引起的结膜囊肿；另一种是先天性结膜囊肿。
不同的结膜囊肿导致的结果不一样： 一、常规的结膜囊肿,比如：因为结膜下进入了上皮组织或长时间用眼过度导致淋巴管堵塞而形成的囊肿，这些常规囊肿不会导致失明； 二、有的看着是囊肿，其实是因为别的原因而引起的炎症，比如：是因为巩膜的炎症或结膜出现了一些特殊的慢性炎症而引起的囊肿，这种囊肿要引起重视，要及时到医院检查和治疗，否则可能会因为耽误病情而引起失明。
不同情况对症治疗： 一、在原来手术的位置残留了一些上皮组织，或者切除的很干净，但上皮组织又裹进去了，这样在原位又长出现一个囊肿。这种情况下需要重新做手术，术后加强用药，抑制它再次复发。 二、因为一些其它的原因，比如炎症反应，用眼过度等导致在原来的位置，又重新长了一个囊肿。这种囊肿先常规用药，观察一段时间，如果不消退，就要在那个位置再做一个手术. 切除以后，为了预防复发，要注意：第一是避免用眼过度；第二是要注意保持眼睛的干净；第三就是控制饮食；第四是用一些特殊的眼药水控制；第五，保持家里湿润。这样的话复发的几率小而且即使复发了也会很轻，不用再手术了。"
