中医学理论是阴阳五行，它的阴阳是木、火、土、金、水，脏腑阴阳相对应，五色是，青、赤、黄、白、黑。藏医发病原理是阴阳失调，诊断是望闻问切，辨证是八纲辨证为纲领，藏医学它的五行是土、木、火、气、空，相对应的是培根、培根、赤巴、隆
中医学理论是阴阳五行，它的阴阳是木、火、土、金、水，脏腑阴阳相对应，五色是，青、赤、黄、白、黑。藏医发病原理是阴阳失调，诊断是望闻问切，辨证是八纲辨证为纲领，藏医学它的五行是土、木、火、气、空，相对应的是培根、培根、赤巴、隆
藏医诊脉的部位与中医相似，但略有差异，中医诊脉以腕后、桡骨、头茎突出处为关，关之掌侧为寸，关之肘侧为尺，三个部位顺序以食指、中指、无名指寸关尺。藏医诊脉也有冲、甘、恰之分，也用食、中、无名三个指头分别按冲、甘、恰三部。但藏医的寸位于腕后第一横纹一寸之处，藏医以大拇指末节的长度为一寸，因此藏医的诊脉部位较中医略偏向肘窝部，这是二者的差异所在。
关于疾病发生的机理藏医认为归根结底就是隆 、赤巴、培根三者之间失去平衡和协调使身体的元气受到伤害而危及健康。因此治疗的目的就是调节这三块的平衡，达到从新协调的目的，藏医由于民族的关系，对人体的构造有着具体深入的了解，在各种传统医学体系中是最先进的一种。
《晶珠本草》又名《药物学广论》或《无垢晶串》是著名药学家帝玛尔–丹增彭措所著.《晶珠本草》约于1735年完成此书，《晶珠本草》集藏本草之大成，是藏医中的《本草纲目》，记录每一种药物，生长环境、性味、功效进行描述。根据药物来源，生长环境，质地，入药部位不同分别阐述。
藏族医学历史悠久。早在远古时代，生活在西藏高原的居民，在同大自然作斗争中就逐步的认识到了一些植物的性能及其作用，及其作用于治疗的一些经验；在狩猎的过程当中，又逐渐知道了一些动物的药理作用，对藏医学的发展起到了一定的作用。
敦巴辛饶是最早的藏医，象雄是藏族文化最早的发源地，也是雍仲本教创始人辛饶弥沃如来佛祖的诞生地。他撰写了《藏医九显论》等一些理论著作。雍仲本教的第一本“医典”记载，杰布楚西后来成为敦巴辛饶的医学继承人,并将敦巴辛饶的医学论著编纂命名为《多个梦移》,此书就是我们现在使用的《四部医典》中的宗源书之一
