无论是开放手术还是微创手术都有一定的并发症，各种并发症的发生与患者的一般情况、是否合并其他疾病、脊柱疾病本身的复杂程度以及医生的水平等因素均有很大的关系。如果患者是高龄，合并有心脏病、高血压、糖尿病、脑血管病等各种疾病，那么并发症就相对较高；如果病人脊柱疾病十分复杂，那么并发症也会相对较高。一般来说，只要严格把握适应证，在有经验的脊柱外科医生操作下，脊柱微创手术的并发症不会比常规手术更高，而且由于脊柱微创切口相对较小，对组织损伤小，其所引起的术后残留性腰痛及切口感染等相关并发症反而会更少。常规开放手术和微创手术方法治疗脊柱疾病术后患者均有出现疾病复发的可能性，以感染，脑脊液漏，神经损伤，腰椎间盘突出症为例。
无论是开放手术还是微创手术都有一定的并发症，各种并发症的发生与患者的一般情况、是否合并其他疾病、脊柱疾病本身的复杂程度以及医生的水平等因素均有很大的关系。如果患者是高龄，合并有心脏病、高血压、糖尿病、脑血管病等各种疾病，那么并发症就相对较高；如果病人脊柱疾病十分复杂，那么并发症也会相对较高。一般来说，只要严格把握适应证，在有经验的脊柱外科医生操作下，脊柱微创手术的并发症不会比常规手术更高，而且由于脊柱微创切口相对较小，对组织损伤小，其所引起的术后残留性腰痛及切口感染等相关并发症反而会更少。常规开放手术和微创手术方法治疗脊柱疾病术后患者均有出现疾病复发的可能性，以感染，脑脊液漏，神经损伤，腰椎间盘突出症为例。
（1）手术创伤小：与常规开放手术相比，脊柱微创手术切口更小，对椎旁肌肉的损伤也明显减小。 （2）疗效满意：研究表明，很多常规开放手术的患者术后腰背部疼痛缓解不明显，而且术后的磁共振检查发现腰背部的肌肉在术后较长时间中都出现明显的水肿和瘢痕，这主要是由于开放手术对椎旁肌肉软组织损伤过大引起的。而脊柱微创手术由于对椎旁肌肉等软组织损伤小，患者术后很少发生腰背部疼痛，疗效满意。 （3）恢复快：常规开放手术由于对脊柱的结构以及对椎旁肌肉破坏更大，所以术后容易引起脊柱的失稳，且切口局部疼痛持续时间较长，术后往往需要1-3个月的恢复期。而脊柱微创手术由于对脊柱结构和椎旁肌肉软组织破坏小，术后恢复更快。 （4）手术出血少：微创手术小暴露，切口小，所以出血也很少，往往不需要输血，有利于患者的恢复等
手术切口更小对椎盘肌肉的软组织的剥离小、创伤小、出血少、伤口斑痕小，而不影响伤口的美观。第疗效比较满意后路开放手术患者术后腰背疼痛比较明显，在于患者术中大量的剥离肌肉、损伤软组织有关，而微创手术对肌肉软组织的剥离小、创伤小，术后患者的腰背疼痛发生率很低。常规手术对脊柱后方的软组织，尤其是肌肉的剥离很大患者术后常常需要卧床时间比较长，容易出现术后脊柱不稳。疾病复发或者再发时可以得到很好的再手术的机会，手术后都存在着复发率的问题，而微创手术根管镜下椎间盘的切除，它不损伤脊柱后方的组织结构椎间盘突出过后，可以进行传统的后路开放手术进行补救，而传统的开放手术后患者局部椎管内粘连很重，组织损伤很重组织结构不清再手术的时候难度很大并发症很多。
脊柱微创手术是脊柱外科最新发展方向，脊柱微创手术仍然是年轻发展中的技术，目前存在着倾向过度追捧扩大疗效。另一方面倾向就是过度的怀疑甚至鄙视的目光怀疑技术，对于脊柱微创手术存在着以下的几个误区：认为脊柱微创手术不等同于开刀手术，实际从外科医生角度来说任何疾病的治疗都分为保守治疗和手术治疗，不开刀的治疗就是保守治疗，而脊柱微创手术也是属于手术治疗，相对于传统的大切开开放手术而言，可以把脊柱微创手术解读为小开刀的手术，而传统的手术可以解释为大开刀手术。如果病情比较严重手术方案的选择可能就选大手术，手术效果就很好。
任何手术都有它的风险，脊柱微创手术相对于传统手术来说它的风险要小，但也有它不可避免的风险。例如麻醉意外、心脑血管意外，脊髓神经血管的损伤、伤口的感染，术后症状不缓解、间盘切除不彻底存在着一定的复发率。器件断裂残留于体内需要开放手术取出来，因患者的解剖变异个体间的差异，穿刺部位到达不了病灶手术可能进行不下去。对于多节段的椎间盘突出或者合并腰椎的不稳，可能术后症状缓解不满意需要再次开放手术治疗。术后椎间盘再次复发或者相邻节段的椎间盘复发，需要再次手术治疗。老年性的腰椎间盘突出，髓核碎裂比较严重或者脱入椎管，手术切除不彻底，术后腰围保护不利术后活动过早，体力劳动过早，导致椎间盘突出再次复发，其他的不可预见的因素也会引起手术的风险。
脊柱微创手术是外科手术，它的禁忌症和技术特殊的禁忌症，病人有严重的心、肝、肺、肾等功能不全，全身情况很差。病人有出血性疾病、高血压、糖尿病没有控制尤其是近三个月发生心肌梗塞、心绞痛的频繁发作以及脑梗塞。病人有严重的脏器下垂。患者对本技术高度怀疑。其他的社会、经济、心理学的因素，例如患者有严重的抑郁症有精神分裂症等。第六点患者手术部位的感染和全身性的感染，没有得到很好的控制。每一种脊柱微创手术技术都有适应症和禁忌症，就以根管镜治疗腰椎间盘突出为例来说，这个技术的禁忌症腰椎间盘突出伴有明显的腰椎不稳。过度的骨质的增生、黄韧带的增生、后纵韧带的骨化、关节突的增生。腰4 5有明显的椎管狭窄、髓核脱出或者是突出向椎管里面超过椎体边缘4毫米以上。患者对本技术高度怀疑，不愿意接受本技术的治疗。
