慢性化脓性中耳炎是中耳疾病里最多见的，容易与它混淆的疾病有：
第一、有外耳的疾病有慢性外耳道炎，也经常表现为耳流液或者流脓，以及听力的减退。
第二、外耳道湿疹一样的皮炎，也和它表现相继，特别是外耳分泌物多，中耳在检查看不清的情况下容易被认为是中耳炎，而实际上很多病人可能就局限在外耳道炎。
第三、中耳胆脂瘤也有可能与中耳炎混淆。
慢性化脓性中耳炎应该和以下三种疾病相鉴别： 第一、慢性鼓膜炎，这种疾病也可能表现为耳内流脓，鼓膜上也可以增生出肉芽。但这种往往鼓膜没有穿孔，而且如果做CT一般提示鼓室、乳突是正常的。 第二、中耳癌，这种也可以表现为耳内的长期流脓史，有时候可能甚至会有耳内出血、耳痛、进而可能发展为张口困难。如果做CT检查，一般可发现颞骨的骨质会有破坏。如做活检也能进一步的确诊。 第三、结核性中耳炎，这也是以耳内流脓为主，且听力的损失较明显。在专科检查时也可看到鼓膜大穿孔，包括伴发有肉芽组织。这种一般伴发于全身的结核病灶，比如肺部的结核灶，而且通过活检也可以进一步的确诊。
慢性化脓性中耳炎是中耳疾病里最多见的，容易与它混淆的疾病有： 第一、有外耳的疾病有慢性外耳道炎，也经常表现为耳流液或者流脓，以及听力的减退。 第二、外耳道湿疹一样的皮炎，也和它表现相继，特别是外耳分泌物多，中耳在检查看不清的情况下容易被认为是中耳炎，而实际上很多病人可能就局限在外耳道炎。 第三、中耳胆脂瘤也有可能与中耳炎混淆。
容易与强直性脊柱炎混淆的疾病有：老年的骨性关节炎。老年的骨关节炎是好发于中老年人，一般都是40岁以上，它的病变特点是退行性疾病，表现为关节的肿胀、疼痛，X线表现是骨质增生，它常侵犯的是下肢的负重关节，如膝、髋关节、膝关节。而强直性脊柱炎的特点是首先出现的是下背疼痛、下背部疼痛，它最先侵犯的是骶髂关节，之后是沿着骶髂关节向上，到腰椎、胸椎、颈椎，是向下到髋关节，强直性脊柱炎与HLA-B27有强相关性，患病的病人阳性率高达 88%到94%。
容易与化脓性脑膜炎混淆的疾病有：1、非化脓性脑膜炎。非化脓性脑膜炎也会出现发热、头疼、脑膜刺激症，但非化脓性脑膜炎的脑脊液细胞反应多为淋巴细胞，而化脓性脑膜炎的脑脊液中细胞增多，以多核白细胞为主。2、机械化学中毒性脑膜损害。3、癌细胞脑膜病。4、出血性的脑血管病。
诊断慢性咽炎的时候都是要先排除掉，全身其他器官和系统的疾病之后才能下这个诊断，你一说症状我们先考虑排除你的这个鼻窦炎扁桃体炎支气管炎，心血管的系统的疾病，免疫系统的疾病，还有这个比如说，贫血 消化系统的问题，把这东西全排除完之后，我们才能够，下慢性炎这个诊断。 比如说我们临床上就遇到过这种反反复复，这个咽部异物感咽部不舒服，但是找不着病因什么都查完就找不到原因，最后在心血管内科，查到了心脏的疾病，当时如果按慢性咽炎就是病人不用管了，直接回去吃药那就可能耽搁了大事。
我们知道慢性萎缩性胃炎的临床症状是不典型的，比方说它可以有胃痛，有胃胀、有嗳气、有反酸、有烧心，这些症状很多消化系统疾病都可以出现，比方说消化性溃疡，它可以表现出胃脘部的疼痛，但是消化性溃疡的，胃腕部疼痛多比较有规律，呈慢性、周期性、节律性的发作，这时候我们就需要做胃镜检查，来明确鉴别，比方说功能性消化不良，我们也可以有胃脘部的胀满，胃脘部的疼痛不适，它与慢性萎缩性胃炎的，临床表现也很近似，这时候我们可以做胃镜检查，除外一下，功能性消化不良的胃镜检查，是正常的，比方说慢性萎缩性胃炎的，胃脘部疼痛、胀满，可以出现在早胃癌，但是如果进展期的胃癌，多伴有进行性消瘦，早期胃癌患者的消瘦症状，可以不严重，这时候我们又可以做胃镜检查，进展期的胃癌，跟慢性萎缩性胃炎，是非常容易鉴别的，针对早期的胃癌，我们现在的内镜技术，也非常的先进，比方说美兰染色，我们可以观察到，病变部位的癌变，比方说共聚焦内镜等等，可以对病变部位进行放大观察，提高早癌的检出率。
