巧克力囊肿和卵巢囊肿的主要区别就是发病因素不同。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症异位到卵巢上，所以会出现比较明显的痛经，也会伴有不规则的阴道流血。巧克力囊肿的发生是有原因存在的，比如在月经期间同房或者是做了手术之后，容易形成巧克力囊肿。
而卵巢囊肿跟体内的激素分泌紊乱、盆腔的炎症刺激有关，所以卵巢囊肿有炎性的囊肿，也存在生理性囊肿或者是病理性囊肿。如果卵巢囊肿比较大超过5厘米，可能会出现破裂或者扭转，所以会出现下腹部疼痛。一般卵巢囊肿比较小的情况下，不会出现明显的疼痛。
巧克力囊肿和卵巢囊肿的主要区别就是发病因素不同。 巧克力囊肿是子宫内膜异位症异位到卵巢上，所以会出现比较明显的痛经，也会伴有不规则的阴道流血。巧克力囊肿的发生是有原因存在的，比如在月经期间同房或者是做了手术之后，容易形成巧克力囊肿。 而卵巢囊肿跟体内的激素分泌紊乱、盆腔的炎症刺激有关，所以卵巢囊肿有炎性的囊肿，也存在生理性囊肿或者是病理性囊肿。如果卵巢囊肿比较大超过5厘米，可能会出现破裂或者扭转，所以会出现下腹部疼痛。一般卵巢囊肿比较小的情况下，不会出现明显的疼痛。
巧克力囊肿大多数情况下没有明显的症状，只是妇科检查或者是B超检查时被发现。 较大的巧克力囊肿可以出现频繁的破裂，囊液流入盆腔，在盆腔受炎症刺激后形成粘连，包括卵巢组织会导致卵巢的激素分泌、卵子的排出出现异常，进而影响女性的月经以及女性的受孕。 当发现卵巢的巧克力囊肿时，需要及时的进行手术治疗，切除病灶以后，复发率仍然较高，还需要通过药物治疗的方式预防复发。如果有受孕的需求可在进行手术和药物治疗以后，尽快的安排受孕。
巧克力囊肿的病因目前尚不十分清楚，有几种因素可供参考。 常见的原因是考虑经血逆流，是由于月经期子宫内膜的组织经过宫腔、输卵管，在卵巢表面种植，而形成的巧克力囊肿。也可能是由于卵巢表面的细胞，通过外在的刺激，而分化成为了子宫内膜样组织，继而形成了巧克力囊肿。 巧克力囊肿出现以后，大多没有明显的症状，如果逐渐增大，有可能导致囊肿破裂，形成了盆腔内的炎性反应以及组织纤维化，导致卵巢与临近器官组织紧密粘连，形成囊肿固定、不活动，影响卵巢的激素分泌以及卵子的排出。
巧克力囊肿虽然是种良性疾病，但它具有恶性行为。如是因为不怀孕查出有巧囊，手术目的就是促使怀孕，最好的手术方式是在腹腔镜下巧囊的完整剥除，还有彻底的盆腔冲洗。另外是对输卵管的检查，有时会通过子宫注入液体来检查输卵管的通畅度，还有对于盆腔黏连的彻底松解，术后要盆腔内注入防止黏连的药物。术后最好半年之内在医生的指导下尽快受孕，半年后受孕几率就会下降，而且复发的机会也会增加。
巧克力囊肿形成的原因目前尚不完全清楚，考虑有以下几种原因： 1、由于经血逆流，子宫内膜的腺上皮和间质细胞，可随经血沿输卵管进入盆腔，在卵巢表面种植，继续生长蔓延，形成卵巢的子宫内膜异位囊肿； 2、由于卵巢表面的上皮受到了某些刺激，继而出现了化生，发育成为了子宫内膜异位的病灶。 3、也可能是由于遗传、免疫和其他因素，继而导致了子宫内膜在卵巢部位生长，但具体的原因尚不完全清楚。 巧克力囊肿大多没有典型的临床症状，多是B超检查时被发现，发现后可以通过药物或者手术的方式进行治疗。
巧克力囊肿是指卵巢囊肿里面的陈旧血液，像粘稠的巧克力液一样，因此，叫做巧克力囊肿。 巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一个表现形式。子宫内膜异位症就是在宫腔内的子宫内膜每个月脱落一次，形成女性的月经。异位的子宫内膜就是当子宫内膜异位到卵巢内以后，也会像来月经一样，每个月出一次血，当它反复的周期性出血以后，血排不出去，就会在卵巢内形成囊肿。囊肿存在的时间长了，它的内部的血液就会变得陈旧，呈巧克力色，黑褐色，就会形成很粘稠的像巧克力样的东西。所以，就叫巧克力囊肿。
