第一、局部治疗，对远端侧缘甲下型和白色浅表型可选用30%冰醋酸，10%水杨酸软膏，2.5-5%碘酊等每日2次外用，也可外用5%阿莫罗芬甲擦剂，每周1次。每次用药前应先修刮病甲，以利药物渗入，也可用30-50%尿素软膏或15%水杨酸软膏封包病甲，使病甲软化脱落，禁用抗真菌药物外涂。
第二、全身治疗，近端甲下型或局部治疗无效者，可内服伊曲康唑，采用间歇冲击疗法，使用第1周服药，每次200mg，每日2次，指甲真菌病2-3个冲击，足甲真菌病3-4个冲击。
第一、局部治疗，对远端侧缘甲下型和白色浅表型可选用30%冰醋酸，10%水杨酸软膏，2.5-5%碘酊等每日2次外用，也可外用5%阿莫罗芬甲擦剂，每周1次。每次用药前应先修刮病甲，以利药物渗入，也可用30-50%尿素软膏或15%水杨酸软膏封包病甲，使病甲软化脱落，禁用抗真菌药物外涂。 第二、全身治疗，近端甲下型或局部治疗无效者，可内服伊曲康唑，采用间歇冲击疗法，使用第1周服药，每次200mg，每日2次，指甲真菌病2-3个冲击，足甲真菌病3-4个冲击。
灰指甲医学上称之为甲真菌病，实际上就是指甲受真菌感染引起的指甲改变；灰指甲的治疗分为两种方式：第一、系统用药，就是口服药，比如伊曲康唑、特比萘芬、氟康唑；第二、外用药，比如冰醋酸、环吡酮胺、阿莫罗芬；另外还可以用尿素软膏，把指甲的灰指甲剥了，指甲软化之后可以让指甲重新生长。
治疗灰指甲主要用的药物是口服药物治疗，第一个指甲是比较厚的外用药物很难渗透，所以它只能起到辅助的作用，要想彻底地治好灰指甲一般是选用口服药物进行治疗。而且口服药物的治疗周期是与指甲的生长时间有关系的，像手上的指甲说明书上介绍的是两个月，我们在临床上基本上是需要用到四个月，脚上的这种灰指甲说明书上介绍是三个月，而在临床上发现大概需要六个月左右，而且随着有患者的年龄大指甲生长慢有可能时间需要延长。
对于不同致病菌引起的各种类型的甲真菌病，应依据抗真菌药物的抗菌谱或参考致病菌的药敏试验结果，选择口服抗真菌药，如皮肤癣菌所引起的甲真菌病可选用伊曲康唑和特比萘芬，如果是其他真菌引起的甲真菌病，应选用伊曲康唑，若未能分离到致病菌，或无条件进行体外药敏试验时，可选用广谱的抗真菌剂，如伊曲康唑，同时可以联合外用药治疗，刮除甲板病变部分，单个甲受累时，辅以拔甲手术等，将有利于病灶的清除。对于远端甲下型甲真菌病，且甲根部位受累的患者，可内服药物医疗城后改外用药或单用外用抗真菌剂治疗。
最常见的还是分两大类，一个是外用药，一个是系统口服药，跟指甲的类型有关系，首先要根据它的类型，远端甲下型和一些浅表型，因为有些身体的原因就不能吃口服药的患者，我们就建议他外用药，但是外用药一定要坚持，一般建议用到三个月到半年的时间，脚趾甲因为生长更新的更慢一些，一般更新的时间从甲根到远端，全部更新的话，要半年到一年的时间，如果脚趾甲灰指甲的话，搽药建议要坚持半年到一年，近端甲下型和全甲营养不良型的灰指甲，如果他身体条件允许的话，没有什么禁忌症，建议他口服药系统治疗，这样才能提高它的治愈率。
灰指甲的治疗方法应看是哪一个类型的，如果仅仅是指甲表面有一点感染，或者是指甲缘有一点感染，可以选择一些外用药治疗。但是指甲比较厚，专门治指甲癣的药膏难渗透到里边去，因此最主要的治疗是口服药，如伊曲康唑、特比萘芬。灰指甲治疗时间比较长，手指甲一般要治疗三个月左右，脚指甲要治疗四个月或者更长的时间，这要看指甲生长的速度来定。最后要长出好的指甲来，起码是大半个指甲是好的，而且查真菌没有了，这时才能够停止治疗。灰指甲跟手足癣一样，也是真菌传染，它是一个发源地，指甲碰到正常哪个部位的皮肤，如果皮肤有外伤就会引起那个地方的感染，所以它是一个传染播散的发源地。
