1、阴茎再造手术可以恢复良好的排尿功能，尿流有一定的射程，可在女方的协作下，完成插入尿道的功能，因此可以性交及生育。
2、经由阴茎再造手术获得的人造阴茎具备促进生育的功能，但是没有性感觉。
3、男性生殖器勃起主要依赖于海绵体，在实验室没有办法培养出海绵体，也无法再造出海绵体，海绵体是不可复制的，就如同没有电话机，即便接通了电话线也不可能有通话功能。人造阴茎也是如此，即便接通了神经和血管，也不具备响应神经发出的指令的硬件配置。
男性阴茎神经末稍非常丰富，在显微镜下观察其切片发现，感觉受体、压力感受器等比正常皮肤都高，人造阴茎皮肤来自身体其他部位，只有它原来的感觉，不能传达性感觉。现在阴茎再造手术中，如果时间充足，选定取材部位后，可以让夫妻练习抚摸，建立起神经反射，形成性感觉区，就比较好一点，有利于获得部分性感觉。
诸多阴茎再造手术的临床实践证明，该整形术在治疗阴茎缺损症方面疗效切确。当然，事无完美，阴茎再造手术也不例外，该手术并不能完全修复阴茎的性功能。求医者在术前须认同手术疗效，避免术后纠纷的发生。