秋季上吐下泻是由多种因素引起的，常见原因有细菌感染、病毒感染、食物中毒。针对不同的病因，需要采取相应的治疗措施。
1、细菌感染。通常由于食物或饮水中受到细菌污染引起，引起的症状包括腹泻、呕吐、腹痛等。可遵医嘱使用抗生素如阿莫西林、头孢克肟等治疗，同时注意保持足够的水分和营养。
2、病毒感染。通常是由于口腔或鼻腔中的病毒进入消化道引起的。治疗方面主要是采取对症支持治疗，包括多休息，保持水分，少食多餐，口服止泻药如蒙脱石散，止吐药物如多潘立酮、甲氧氯普胺，抗病毒药物如利巴韦林、奥司他韦。
3、食物中毒。秋季气候干燥，容易造成食物的滋生，食用未经充分加热或保存不当的食物，容易引起食物中毒。治疗方面需保持患者身体有足够的水分，同时可遵医嘱使用抗生素或抗毒素治疗，如头孢呋辛、头孢地尼、阿昔洛韦、利巴韦林，同时根据病情加强对食物安全的管理。
治疗期间患者还要注意个人卫生，避免食用未加工或未经充分加热的食物，保持室内空气湿润。