停经50天B超看不到孕囊可能是未怀孕、生化妊娠、怀孕时间不准确、孕囊发育异常、异位妊娠引起的。
1、未怀孕：停经不是判断怀孕的绝对指标，还可能是多囊卵巢综合征、子宫肌瘤等疾病或是更年期停经引起的，并不是怀孕，也就不会出现孕囊。
2、生化妊娠：是指形成了受精卵，但受精卵并没有正常发育，还没有进入宫腔就排出女性体外，无法形成孕囊，多为偶发现象，可能与受精卵染色体异常有关，通常无需治疗。
3、怀孕时间不准确：有些女性可能无法准确确定自己的月经周期，或是排卵时间不确定，会导致B超检查看不到孕囊。如果确认怀孕时间不准确，建议再等待一段时间再进行B超检查。
4、孕囊发育异常：在正常的妊娠过程中，受精卵会在子宫内着床并发育为胚胎，形成孕囊。然而，有时由于胚胎发育不良，孕囊可能未能正常形成或发育，而导致B超检测不到孕囊。建议再等待一段时间再进行B超检查，必要时可以遵医嘱使用黄体酮胶囊、保胎丸等药物来进行保胎。
5、异位妊娠：是指受精卵着床在子宫以外的位置，通常是输卵管内。在此情况下，B超可能无法检测到子宫内的孕囊，因为胚胎并未着床在子宫内。异位妊娠可能会引起剧烈的腹痛、阴道流血以及其他身体不适症状，出现异位妊娠，应尽早进行终止妊娠。
建议出现上述现象，应在医生的指导下完善相关检查，明确病因后进行针对性处理。