二级筛查一般建议在孕期20~24周之间进行。
二级筛查主要需要进行实验室的检查通过抽血检查孕妇以及脏腑的血液指标，同时还需要进行医学免疫学指标和学生遗传以及遗传学指标检查，以筛查胎儿是否存在无脑儿、严重的脑膨出、严重的开放性脊柱裂、严重的胸腹壁缺损伴内脏外翻，以及单腔性、致死性的软骨发育不良等情况。此外孕妇在妊娠20~24周时进行二级筛查，还可以监测胎儿的各项生长发育指标、羊水量、胎盘情况等。
如果二级筛查发现胎儿存在上述情况，通常建议不要继续妊娠，可以遵医嘱使用药物流产、手术流产等人工流产的方式终止妊娠。此外，孕妇在流产后应注意适当休息，保证充足睡眠，饮食上应注意以清淡、易消化饮食为主，避免吸烟、饮酒，或食用辛辣、刺激的食物，如海鲜、麻辣烫、烧烤等，以免影响身体恢复。