HPV转阴后再次检测出16阳性的情况可能有多种原因，治疗方法也会因原因不同而有所区别。
一、原因分析：
1、非持续感染：HPV感染可以是持续或非持续的，非持续感染的情况下，可能在短时间内转阴，但是感染仍然存在。
2、新感染：再次感染新的HPV病毒，导致16阳性。
3、免疫力下降：免疫系统受到影响，导致之前感染的HPV再次复发。
4、检测误差：检测方法和检测设备可能存在一定的误差，导致结果不准确。
二、治疗方法：
1、观察：如果仅是16阳性，可以在医生的建议下进行观察，定期进行HPV检测，如果发现病情进展，再考虑其他治疗方法。
2、祛除感染：对于持续感染的情况，可以通过激光手术或冷冻手术等方法祛除感染部位的HPV病毒，但是并不能根治病情。
3、增强免疫力：通过药物或其他方法增强身体免疫力，预防病情的进展和复发。
总之，HPV感染是一种常见的性传播疾病，如果发现感染，应及时就医，并按照医生的建议进行治疗和观察，同时加强自身的免疫力，预防病情的进展和复发。