治疗肛周脓肿的方法主要包括根治术和引流术两种，这两种手术的主要区别在于手术的目的、手术的方式和手术的预后。
根治术是指将肛周脓肿周围的组织全部切除，包括感染的组织和窦道，以达到治愈肛周脓肿的目的。根治术的特点是治疗效果好，可以完全治愈肛周脓肿，但手术难度大，需要较长的恢复时间。此外，如果手术过程中切除的组织过多，可能会导致肛门失禁等并发症。
引流术则是将肛周脓肿切开，并放置引流管，以便脓液流出，同时配以抗生素治疗。引流术的特点是手术难度较低，恢复时间较短，但治疗效果相对较差，可能会导致肛周脓肿的反复发生。
在手术方式上，根治术通常采用全身麻醉，而在引流术中则通常采用局部麻醉。根治术需要将感染的组织完全切除，并进行窦道清除，而引流术则只需要切开脓肿，并放置引流管即可。
在预后方面，根治术的治疗效果较好，但手术难度大，恢复时间较长，可能会引起一些并发症。而引流术的治疗效果较差，但手术难度较低，恢复时间较短，且可能会引起肛周脓肿的反复发生。
综上所述，根治术和引流术是治疗肛周脓肿的两种主要方法。根治术可以彻底治疗肛周脓肿，但手术难度大，恢复时间较长，可能会引起一些并发症。而引流术则比较简单，恢复时间较短，但治疗效果较差，可能会引起肛周脓肿的反复发生。因此，在选择治疗方法时，应该根据具体病情，结合医生的建议，做出正确的决策。