骨髓炎不能彻底治愈通常与错失较佳治疗时间、容易出现并发症、药物因素等有关。
1、错失较佳治疗时间：部分骨髓炎的患者，因在疾病初期没有发现病情，等待确诊后，其疾病已经比较严重，错失了较佳的治疗时间。通常需要长时间持续性的治疗，由于病程比较长，且会反复发作，因此无法彻底治愈。
2、容易出现并发症：骨髓炎的患者很容易发生并发症，包括骨骼流脓、骨头碎片、患肢活动障碍、骨折等。因并发症不容易治愈，所以疾病无法达到治愈的效果。
3、药物因素：部分患者在发生骨髓炎时，因病变骨组织没有血运，即使采取药物治疗，因药物不能被运载至患处发生治疗作用，若盲目的长时间使用药物治疗，通常会形成恶性循环，导致病情越来越严重，甚至导致人体菌群紊乱，从而影响恢复。
除以上原因外，还可能是认识错误、治疗方法单一、不合理、不科学等原因所致。