大量运动后肾会疼可能是生理性原因所引起，例如交感神经兴奋，但也不排除是病理性的原因，例如肾盂肾炎、肾结石等。
一、生理性原因
多数是因为患者在运动之后导致交感神经异常，使腰部的肌肉组织异常痉挛，并产生大量乳酸，堆积在肾部周围，不能够及时排出，引起肌肉组织疼痛，并向肾区放射。通常是不需要特殊治疗的，适当休息之后就能够恢复正常。
二、病理性原因
1、肾盂肾炎：多数是由细菌、病毒以及真菌等入侵肾盂和肾实质部位，引起的炎症反应，运动的时候使体内的炎症反应加重，对周围的组织造成刺激，引起了疼痛、食欲不振、恶心、呕吐等。可以在医生的指导下口服阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片、罗红霉素胶囊等。
2、肾结石：如果本身患有肾结石，运动的过程当中会使结石的位置发生一定变化，引起肾黏膜组织破溃，诱发不同程度的疼痛、恶心、呕吐等不适症状。可以口服排石药物治疗，比如枸橼酸氢钾钠颗粒、碳酸氢钠片、消旋山莨菪碱片等。
另外，肾病综合征、肾囊肿也会出现疼痛症状，可前往医院完善相关检查，然后进行诊断。