囊肿痤疮是痤疮的表现形式之一，属于重度痤疮，其治疗措施包括药物治疗和物理治疗，但不存在最佳治疗。
一、药物治疗
1、抗生素类药物：适合于囊肿痤疮的抗生素类药物需具有抗厌氧菌的作用，比如甲硝唑凝胶、克林霉素磷酸酯凝胶、克拉霉素胶囊等药物，可以杀灭痤疮丙酸杆菌，减轻炎症反应。
2、维A酸类药物：比如阿达帕林凝胶、维A酸片、维A酸乳膏等，可调节皮脂代谢，抑制痤疮丙酸杆菌增殖，减轻炎症反应。
3、抗雄激素类药物：常用药物主要包括螺内酯片、醋酸环丙孕酮片、醋酸甲羟孕酮片等，主要适合于女性患者。
二、物理治疗
单纯药物治疗没有显著效果的情况下，可以在医生指导下进行物理治疗，常用治疗方法包括红蓝光治疗、光动力治疗，有调节角质代谢、抑制痤疮丙酸杆菌增殖、减轻炎症反应的作用。