40天婴儿发烧常见原因有呼吸道感染、消化系统感染、泌尿系统感染等。
1、呼吸道感染：婴儿的呼吸道黏膜柔嫩、富含血管以及淋巴管，且气道短，容易受到致病菌入侵，比如呼吸道合胞病毒、腺病毒、肺炎链球菌等，患儿除了发热外，还可表现为咳嗽、流涕、鼻塞等症状。这类患儿应在医生的指导下进行抗感染治疗，常用药物有头孢克肟、左氧氟沙星、阿莫西林等。
2、消化系统感染：婴儿的消化系统黏膜屏障功能还没发育成熟，自身免疫功能低下，容易出现病毒感染，如大肠埃希菌、轮状病毒等，导致患儿出现呕吐、腹泻、腹胀等不适。此时可以遵医嘱服用益生菌、阿莫西林、哌拉西林等药物进行治疗。
3、泌尿系统感染：婴儿会长时间使用尿不湿，如果没有及时更换，就会滋生细菌，引起感染，患儿就可能会出现排尿、哭闹、尿频、发热等不适症状。一旦确诊，可在医生的指导下使用头孢克肟、氨基苄青霉素等药物进行治疗，并注意及时为宝宝更换尿不湿。
此外，还需要警惕败血症、脓毒血症、颅脑感染等疾病，建议家长引起重视，必要时及时带患儿就医，查明原因后进行针对性的治疗。