晚上睡觉被肛门坠痛醒有可能是便秘、肠炎、痔疮导致，需要做相关的检查以确诊。
1、便秘：一般会出现大便干结和身体不易排便，可能会导致肛门部位的大便刺激肛门组织和容易出现睡觉期间肛门坠痛等不良的症状。可以在医生指导下使用芦荟胶囊、麻仁润肠丸等药物治疗。
2、肠炎：会导致肠道黏膜组织出现水肿，可能会使身体出现大便次数增多和引起肛门部位疼痛和引起容易醒的症状。可以遵医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢克肟片、蒙脱石散等药物治疗。
3、痔疮：会导致肛门局部出现肿物，还可能会导致肛门局部出现肿胀和坠痛的症状，可能会引起患者疼痛和容易反复性。可以遵医嘱使用熊胆痔疮膏、麝香痔疮膏等药物治疗。
除以上的原因以外，也可能是肛门息肉等原因导致，需要配合医生针对性治疗。