直肠黏膜充血水肿可以通过饮食调整、口服用药、局部用药的方法来治疗，都可以达到很好的治疗效果。
1、饮食调整：在日常生活中还需要注意好饮食调整，需要做到清淡饮食为主，减少油腻性和辛辣刺激性的食物摄入。
2、口服用药：出现直肠黏膜充血水肿很可能是炎症感染所引起的，一般和肠道感染有一定的关系，一般需要通过用药的方法改善，需要在医生指导下使用阿莫西林胶囊、罗红霉素分散片、阿奇霉素分散片等药物进行调整。
3、局部用药：如果是由于痔疮所导致的直肠黏膜充血和水肿，可以使用九华痔疮栓、方角菜酸脂栓等药物治疗，能起到消肿止痛的作用。