患有轻微肠溃疡时可以通过服用补脾益肠丸、柳氮磺胺吡啶、黄连素进行治疗。具体什么药物最有疗效要根据患者的实际情况而定。
1、补脾益肠丸：具有温阳行气、益气养血、涩肠止泻的功效，常用于治疗脾虚气滞所引起的腹胀疼痛、粘液血便、溃疡性结肠炎、轻微肠溃疡等病症，因此患有轻微肠溃疡时可以遵照医嘱服用该药物来缓解病情。
2、柳氮磺胺吡啶：是比较常见的一种抗菌类药物，服用后能够有效的起到抑菌效果，常用于治疗消化道疾病，比如轻微肠溃疡、溃疡性结肠炎等，因此患有轻微肠溃疡时也可以遵医嘱服用该药物改善。
3、黄连素：是常见的一种中药，具有止血、清热燥湿的作用，常用于治疗肠道感染性疾病，比如肠溃疡、痢疾感染等，被确诊为轻微肠溃疡时也可以在医生指导下通过服用黄连素进行治疗。
除上述药物以外，也可以服用莨菪片等药物改善。