一跑步头疼可能是运动时间过长引起的，也可能是低血糖、颈椎病等原因导致的。
1、运动时间过长：如果跑步的时间较长超出生理极限时，可能会导致脑部缺血、缺氧，引起头疼现象，一般在休息后可以逐渐缓解，在平时也应注意跑步的时间不宜过长。
2、低血糖：对于低血糖的人群，如果在空腹的状态下跑步，由于血糖低于正常的范围，大脑中枢神经系统的能量供应不足，因此也可产生头疼的现象，可以通过口含糖块或者饮用含糖的饮料进行缓解。
3、颈椎病：当发生颈椎病时，若在跑步的过程中，脊椎病变的部位刺激或压迫椎动脉周围的交感神经丛也可产生头疼现象，在平时也会有颈肩疼痛、颈肩僵硬等表现。当发生颈椎病时，可以通过按摩、牵引等方法进行缓解，如果头痛症状比较严重，还可给予药物进行改善，如对乙酰氨基酚片、洛索洛芬钠胶囊、塞来昔布胶囊等。
此外，还有可能是贫血、营养不良、高血压、脑血管痉挛等原因引起的，建议积极就医，查明原因后进行针对性的治疗。